全基因組重測(cè)序

簡要描述：全基因組重測(cè)序是對(duì)基因組序列已知物種的個(gè)體進(jìn)行基因組測(cè)序，并在個(gè)體或群體水平進(jìn)行差異性分析的方法。

更新時(shí)間：2022-12-22
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詳細(xì)介紹

一、全基因組重測(cè)序服務(wù)介紹

全基因組重測(cè)序是對(duì)基因組序列已知物種的個(gè)體進(jìn)行基因組測(cè)序，并在個(gè)體或群體水平進(jìn)行差異性分析的方法。基于全基因組重測(cè)序技術(shù)，我們能夠快速的進(jìn)行種子資源普查篩選，尋找到大量基因變異，并實(shí)現(xiàn)遺傳進(jìn)化分析及重要性狀候選基因預(yù)測(cè)。而隨著測(cè)序成本降低和已知基因組序列的物種增多，重測(cè)序已成為動(dòng)植物育種研究中為迅速有效的方法之一。

二、全基因組重測(cè)序操作流程

提取基因組 DNA 并隨機(jī)打斷，電泳回收所需長度的 DNA 的片段，并加上接頭進(jìn)行 Cluster制備，后上機(jī)測(cè)序。利用雙末端（ Paired-End）的方案對(duì)插入片段兩端進(jìn)行測(cè)序，除獲得序列信息外，還有利于大片段結(jié)構(gòu)變異的挖掘。

三、指標(biāo)評(píng)價(jià)

測(cè)序深度是評(píng)價(jià)測(cè)序量的重要指標(biāo)，測(cè)序深度的增加有利于基因組覆蓋度的上升，并同時(shí)減少測(cè)序的錯(cuò)誤率。在重測(cè)序個(gè)體水平采用雙末端測(cè)序，當(dāng)測(cè)序深度在 10X 以上時(shí)，基因組覆蓋度和測(cè)序錯(cuò)誤率控制均得以。而在群體方面，3-5X 即可得到。

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